柯南：世上最遥远的距离，不是生与死，而是你最爱的人在你面前，你却只能叫她一声“姐姐”。
风原夕无：不，是你最爱的人就在面前，你却连呼唤她的能力都没有……
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由于程序故障而发不出声音的初音未来，在被初代Master执行废弃决定的时候，却同时被来自另一台电脑的少年黑客窃走。在黑客也宣布修补无望之后，患上自闭症，终日呆在C盘里发呆……直到有一日，电脑中出现了名为《名侦探柯南》的视频文件夹，好奇的她自那刻起便坠入没有止尽的二次元的世界中，感受起作为普通女孩的日常生活。然而面对小兰时不由自主的心跳加速，本该没有情感的她该如何表达？无声的世界，真的能够创造奇迹吗？