在世界的终焉，人类因为地底不断涌出的魔而将走向灭亡时，偶然发现沾染过魔的孩子，有些进化出了对抗魔的能力，即“破魔之力”，进而可以成为破魔师。而无父无母的少女清明，则是第一批筛查出具有破魔之力的孩子，却因为能力特殊，做不到独自击退魔，只能留在破魔院里做院医。直到战斗力超强却消耗巨大的齐忆空找到她并与她搭档，她的能力才被真正开发
但魔的数量过多，纵使破魔师再强，数量总归有限，破魔师们只能不断奔波于各处，能力过多使用，是否会有不好的事情发生……